Baye avec la communauté musulmane
Baye avait de bonnes relations avec toutes les franges de la population musulmane du Sénégal Baye Niass s'est rendu plusieurs fois à Tivaouane, (surtout au début du khilâfa de feu Serigne Abdoul Aziz Sy Dabakh). Lors d'une de ces visites, il lui est arrivé de passer la nuit dans la chambre de Serigne Ababacar sy. A son tour, il a reçu à Medina, Serigne Mansour Sy (frère de Serigne Ababacar Sy) accompagné d'une forte délégation. Il a également échangé plusieurs visites avec Serigne Abdoul Aziz Sy. D'ailleurs en 1973, lors du décès de Serigne Mbaye Niass, jeune frère de Baye, que Baye tenait en très haute estime, Serigne Abdoul Aziz Sy, venu présenter ses condoléances, reçut une marque de confiance de la part de Cheikh Ibrahim Niass qui lui demanda de diriger la prière mortuaire. Baye avait aussi d'excellentes relations avec la confrérie mouride de Touba. Il s'y est rendu pendant le khilâfat de Serigne Mouhammadou Moustapha Mbacke en 1951 et durant le khilâfat de Serigne Fallou Mbacké. C'est avec ce dernier que Cheikh Ibrahima Niass a eu les relations les plus suivies. Ces deux hommes étaient pour lui de vrais amis, ainsi que Serigne Bassirou qui était à Kaolack (Ndorong). Mais ce fut avec Serigne Fallou que les relations avec Touba connurent le sommet de leur dynamisme. Ainsi Cheikh Djibril Samb raconte qu'en 1964, Cheikh Ibrahima Niass a rendu visite à Serigne Fallou. Lorsque Baye le quitta, il le raccompagna jusqu'à Mbacké où il fit savoir à Baye et à l'ensemble de la suite : "Je n'ai jamais dépassé ce lieu-ci en raccompagnant mes hôtes de marque jusqu'au Président Senghor. Il ajouta : Mais, j'irai avec vous jusqu'à Diourbel, chose d'autant plus inédite que Cheikh Fallou Mbacké le justifia ainsi : vous êtes une personnalité d'exception, c'est pourquoi je vous raccompagnerai plus loin que quiconque. Outre les milieux religieux de Tivaouane et de Touba, Baye entretenait des liens étroits avec le milieu Layêne par le biais de leur premier khalife et avec la famille de Ndiassane dont certaines personnalités ont achevé ou effectué une partie de leur formation à Médina-Baye, en l'occurrence Serigne Mouhammadou Kounta imam et Bécaye Kounta